На відомство покладено захист від будь-яких спроб незаконного перетинання лінії державного кордону України, збройних конфліктів та інших провокацій на кордоні. Це завдання здійснюється у взаємодії зі Збройними Силами України та іншими військовими підрозділами у відбитті вторгнення або нападу на територію України іншої держави чи групи держав.

Важливими зобов'язаннями Державної прикордонної служби України, які законодавством віднесено до її відповідальності, є:

виявлення та припинення злочинів і адміністративних правопорушень, проведення дізнання, здійснення провадження у справах про адміністративні правопорушення.здійснення прикордонного контролю та пропуску в установленому порядку осіб, транспортних засобів, вантажів та іншого майна.облік іноземців та осіб без громадянства, які в установленому порядку прибувають до України, та їх паспортних документів у пунктах пропуску крізь державний кордон.запобігання в'їзду до України або виїзду з неї осіб, яким згідно з законодавством не дозволяється в'їзд до України або яких тимчасово обмежено у праві виїзду з України, зокрема відповідно до доручення правоохоронних органів.розшук у пунктах пропуску через державний кордон осіб, які переховуються від органів дізнання, слідства і суду, ухиляються від відбування кримінальних покарань.виконання в установленому порядку інших доручень правоохоронних органів.В межах охорони кордону, захисту інтересів громадян та держави, прикордонна служба здійснює розвідувальну інформаційно-аналітичну та оперативно-розшукову діяльність, а також контррозвідувальні заходи щодо забезпечення захисту державного кордону України.

На органи відомства також покладена боротьба із нелегальною міграцією.